医药中间体定制合成是萃程生物一大特色业务，该业务团队由1名有机合成专业博士、1名药物化学硕士和3名应用化学专业本科生组成，团队研发实力强，仪器设备先进，在喹啉类、吡啶类、咪唑类、甾体类、联苯类、含氟类、硼酸及衍生物、氨基酸及衍生物合成等方面具有丰富的经验，能为客户提供优质的产品和服务。
萃程为客户合成参考化合物，医药中间体，候选药物、杂质以及代谢物等各种小分子化学物质，其规模可从毫克级到千克级（包括GMP质量）。我们的团队精通新路线设计和路线优化，凭借解决问题的熟练技能和项目的较高成功率，我们有能力为客户提供以下高质量的化学定制合成服务：从毫克级到公斤级高质量产品制备、特殊试剂、医药中间体合成和分子片段制备、原料药或相关物质的制备、杂质和代谢产物合成设计和制备、分析支持等。
萃程生物公司主要从事高附加值新型医药中间体的研发以及工艺优化，精细化工以及原料药合成的研发和工艺优化，特别致力于天然产物、新药研发所需的特种试剂、医药中间体、以及各种糖类化合物的实验室合成和放大，公司拥有的工场基地和先进的试验设备。公司拥有全面的文献检索系统、高度专业化的化学合成与工艺开发能力以及高水平的合成技术人才。
药物中间体，一般而言是指那些专门用来生产药品的关键原料，如用来生产头孢菌素的关键中间体6-APA（6-氨基青霉烷酸）、7-ACA（7-氨基头孢烷酸）、7-ADCA（7-氨基去乙酰氧基头孢烷酸），各种头孢菌素侧链，以及用于喹诺酮类药品生产的哌嗪及其衍生物等，而不包括那些用于药物生产的基本化工原料，如乙醇、乙酸等。
医药按其用途可分为抗心血管药、抗肿瘤药、调节内分泌系统药、抗生素等，而每类药品中又含有多种结构不同的药物，如：抗生素类包括内酰胺类、大环内酯类、喹诺酮类、氯霉素等。由于医药中间体是主要用于各种药物的生产，所以种类繁杂。
医药工业从生产角度可分为原料药生产和制剂加工两大类；原料药生产按来源可分为天然药物和化学药物，按生产方式可分为天然提取药物、生物合成药物和化学合成药物三大类。
